勾选认证方式适用于纳税信用比较好的增值税一般纳税人进行操作，批量勾选很容易导致每月进项大于销项税额，造成留抵税额而且很多没有入账的发票也在进项账务上冲减了费用。
看到进项票就勾选的风险：
1、目前很多公司开具的发票是不能抵扣的，而且费用和公司业务无关，只是习惯性地给公司开票，打比方很多个人就设定过路费、餐费固定给公司开具发票，导致公司在确认进项税发票的时候勾选了很多无关紧要的发票导致税务风险增大，从而引起税局的注意，一旦被税务局注意将要面临企业带着账本到税局接受检查。
2、批量勾选导致没有入账的发票也在进项账务上冲减了费用。这种操作不仅少缴纳了增值税造成税务风险。而在实际没有发生业务和发票导致多冲减了费用。而且批量勾选很容易导致每月进项大于销项税额，造成留抵税额。
确认勾选的注意事项：
1、勾选操作期：在当期申报/征期结束后至下一期申报当天为可操作期间；增值税征期一般规定为每个月1-15号，如果遇到节假日征期递延，截止日期要以国税局税务机关通知为准。
2、如果跨月税票但税款的归属期没有变更，那就可以继续进行勾选发票进行操作。
基本上本月8日前申报上月的发票，如果忘记申报，恰巧发票所属期没有变更，则本月还可以继续申报。
3、勾选的发票必须是未认证的发票。
4、平台根据获取申报结果信息，判断这次勾选发票是否属于本期所属期，如果已经在征期内申报，平台自动转换税款所属期并将确认过的发票退回，操作人下期重新勾选即可。如果征期内未申报，系统将提示纳税人“尚未从征管系统中获取到申报结果，请再次确认本期增值税申报工作是否完成”；如果显示异常失败，则提示“获取征管系统申报结果异常，请确认本期增值税申报工作是否完成”。
